Höjdpunkter
Det finns flera sätt på genom/genomisk sekvensering av patienters cancerprover kan vara till hjälp, inklusive förutsägelse av cancerrisk, cancerprognos och diagnos samt identifiering av personlig och precision cancer behandling. Det finns många företag som erbjuder olika genetiska sekvenstester för cancer och rätt test kommer att behöva identifieras baserat på specifika sammanhang och cancertyp. Vissa genetiska tester som erbjuds av dessa företag täcks av försäkring men de flesta är baserade på egenbetalning.
Det kan vara överväldigande att skanna igenom recensioner, artiklar, bloggar, rekommendationer osv. Efter en cancerdiagnos. Det finns mycket information, ny terminologi och rekommenderade tester som de flesta av oss är oklara om. Tumörsekvensering, cancer / tumörprofilering, nästa generations sekvensering, riktade paneler, helexome-sekvensering, molekylära egenskaper hos cancer, är allt jargong som vi stöter på. Vad betyder dessa och hur är dessa till hjälp?
Vad är cancergenom/genomisk sekvensering?
Låt oss börja med några grunder i cancer. Cancer är en okontrollerad tillväxt av vissa celler i vår kropp som har blivit onormala på grund av en ansamling av genetiska förändringar i vårt cellulära DNA, som kallas mutationer eller genomiska avvikelser. DNA består av fyra alfabetnukleotider, vars sekvens utgör generna som ger instruktioner för att göra de proteiner som driver funktionerna i våra celler, vävnader och organ. Sekvensering är avkodningen av det genomiska innehållet i cellerna. DNA från cancercellerna och normala icke-cancerceller kan isoleras och tack vare innovationerna och framstegen inom nästa generations sekvenseringsteknologier kan de dechiffreras på nivån av nukleotidsekvensen. Jämförelse av cancer- och kontroll-DNA-sekvenser ger information om de nya och förvärvade förändringarna som vid ytterligare analys ger insikter i de underliggande abnormiteter som driver sjukdomen.
Olika typer av sekvensering
Identifiering av genomiska mutationer och abnormiteter kan göras genom olika tekniker och tester inklusive cytogenetisk karyotypning, amplifiering av specifika regioner av DNA genom polymeraskedjereaktion (PCR), identifiering av specifika abnormiteter och fusioner med fluorescens in situ hybridisering (FISH), genomisk sekvensering av en riktad panel av cancerspecifika gener, eller sekvenseringen av den kompletta uppsättningen gener som kallas helexomsekvensering (WES) eller hela DNA:t i cellen kan sekvenseras som en del av helgenomsekvensering (WGS). För klinisk implementering av cancer profilering är det föredragna alternativet riktad genpanelsekvensering av cancerspecifika gener i intervallet 30 – 600 gener, medan WES och WGS används mer inom forskningsdomänen. Fördelarna med riktad sekvensering är lägre kostnader, större djup av sekvensering och djupare analys av specifika regioner av DNA som kan vara viktiga drivkrafter för cancern.
Mat att äta efter cancerdiagnos!
Inga två cancerformer är desamma. Gå längre än de vanliga näringsriktlinjerna för alla och fatta personliga beslut om mat och kosttillskott med förtroende.
Är cancer genomisk sekvens användbar - vad är dess fördelar?
För en cancerpatient måste man välja rätt testpanel för sin specifika cancertyp. Olika cancerformer är associerade med olika uppsättningar av genmutationer och riktade paneler från olika företag täcker olika uppsättningar av gener. Ett högre täckningsdjup av de genomiska regionerna som sekvenseras har fördelar jämfört med en täckningsbredd man kan få med WES men det kan missa några viktiga fynd. Det saknas fortfarande standardisering över sekvenseringstester och variation i resultat när DNA från samma prov sekvenseras i olika tester, i många fall. Det finns också variation i sekvens baserad på vilken del av tumörprovet som sekvenseras och skillnader ses mellan sekvensering av DNA från ett fast tumörvävnadsprov och cirkulerande tumör -DNA från samma patient. Trots de olika utmaningarna kan informationen från genomisk sekvensering av cancern vara mycket användbar på flera sätt som granskats av forskare från Wellcome Sanger Institute i Storbritannien (Nanglia och Campbell, New Engl J Med., 2019).
Några av de sätt på vilka cancergenom/genomisk sekvensering kan vara till hjälp för att diagnostisera, besluta om behandling och övervaka cancer listas nedan:
- Cancerrisk förutsägelse hos en frisk person som kan ha en familjehistoria av cancer. Sekvensering av DNA från en frisk individs blodprov kan ge information om existerande bakteriemutationer som kan vara närvarande och kan öka framtida cancerrisk. T.ex. närvaro av cancer-disposition genmutationer i BRCA, APC eller VHL.
- Farmakogenomik - germline genomics kan identifiera enkla nukleotidpolymorfismer (SNP) i läkemedelsmetaboliserande enzymer som kan användas för att identifiera patienter med risk för toxiska effekter av kemoterapi.
- Epidemiologi och folkhälsa - genomisk sekvensering av tumörer från regioner där det finns en hög förekomst av en viss cancertyp kan hjälpa till att identifiera miljön, kosten eller andra exponeringar som kan ligga bakom den höga förekomsten av cancer.
- Sekvensering av tidiga skador kan hjälpa till med att bestämma sjukdomsprognosen och behovet av intervention. Genomik med mer antal mutationer / avvikelser och typen av mutationer kan identifieras som de som behöver tidigt och mer aggressivt ingripande.
- Cancerdiagnos genom identifiering av förarmutationer som BCR_ABL, KRAS, TP53 och andra kan bekräfta den underliggande cancer.
- Identifiering av ursprungsvävnad för cancer av en okänd primär. Specifika mutationer är associerade med specifika cancertyper.
- Tumörklassificering kan göras på basis av sammansättningen av förarmutationer och är kopplad till en sjukdomsbiologi som kan behandlas med specifika riktade terapier.
- Förutsäger patientresultat och ger bättre prognos baserat på kliniska och genomiska data. T.ex. Tumörer med TP53-mutationer har sämre prognos.
- Genomsekvensering hjälper till med precisionscancerbehandling- Cancerpatienter har många mutationer och komplementet av mutationer är unikt för varje cancerpatient. Därför skulle en mer personlig och anpassad kombinationsbehandlingsidentifiering som kan hantera effekterna av alla avvikelser vara den heliga gralen för cancerbehandling.
- Identifiera resistensmekanismer genom sekvensering av cancer som inte har svarat på föreskrivna behandlingar.
- Cancerövervakning genom flytande biopsi av cirkulerande tumör-DNA eller cirkulerande tumörceller kan hjälpa till att identifiera återfall av sjukdom eller återfall utan en invasiv biopsi eller operation.
Så som listat finns det flera sätt på vilka cancer genomisk/genomsekvensering kan vara till hjälp, inklusive förutsägelse av cancerrisker, cancerprognos och diagnos, och att identifiera personlig och precisionsbehandling av cancer, även om det inte är mainstream i de flesta onkologiska praktiker.
Var kan du få det genetiska sekvensprovet för cancer gjort?
Det finns ett antal företag som erbjuder genomiskt/genetiskt sekvenseringstest baserat på saliv eller blodprov med olika förmågor som, som nämnts ovan, måste identifieras baserat på specifikt sammanhang, cancertyp och syfte. Det finns några genetiska tester för cancer som erbjuds av dessa företag som nu får ersättning av regeringsplaner som Medicare eller NHS, men i många länder som Indien och Kina betalas dessa tester av patienterna. Rådgör med din vård- och försäkringsleverantör för att få information om de genetiska testerna för cancer som omfattas av din plan. Du kan också kolla in den här sidan för en lista av godtagbara genetiska tester för cancerrisk.
Vilken mat du äter och vilka kosttillskott du tar är ett beslut du tar. Ditt beslut bör inkludera övervägande av cancergenmutationerna, vilka cancer, pågående behandlingar och kosttillskott, eventuella allergier, livsstilsinformation, vikt, längd och vanor.
Näringsplaneringen för cancer från addon är inte baserad på internetsökningar. Det automatiserar beslutsfattandet för dig baserat på molekylärvetenskap som implementerats av våra forskare och mjukvaruutvecklare. Oavsett om du bryr dig om att förstå de underliggande biokemiska molekylära vägarna eller inte - för näringsplanering för cancer behövs den förståelsen.
Kom igång NU med din näringsplanering genom att svara på frågor om namnet på cancer, genetiska mutationer, pågående behandlingar och kosttillskott, eventuella allergier, vanor, livsstil, åldersgrupp och kön.
Personlig kost för cancer!
Cancer förändras med tiden. Anpassa och modifiera din kost baserat på cancerindikation, behandlingar, livsstil, matpreferenser, allergier och andra faktorer.
Cancerpatienter måste ofta hantera olika kemoterapi biverkningar som påverkar deras livskvalitet och ser ut efter alternativa behandlingar för cancer rätt näring och kosttillskott baserat på vetenskapliga överväganden (undvika gissningar och slumpmässigt urval) är det bästa naturläkemedlet för cancer och behandlingsrelaterat bieffekter.