Destaques
Existem várias maneiras de genoma / sequenciamento genômico de amostras de câncer de pacientes pode ser útil, incluindo previsão de risco de câncer, prognóstico e diagnóstico de câncer e identificação de dados personalizados e precisos Câncer tratamento. Existem muitas empresas que oferecem vários testes de sequenciamento genético para câncer e o teste certo precisará ser identificado com base no contexto específico e no tipo de câncer. Alguns testes genéticos oferecidos por essas empresas são cobertos por seguros, mas a maioria é paga por conta própria.
Examinar análises, artigos, blogs, recomendações, etc., postar um diagnóstico de câncer pode ser opressor. Há muitas informações, nova terminologia e testes recomendados sobre os quais a maioria de nós não tem noção. Sequenciamento de tumor, perfil de câncer / tumor, sequenciamento de próxima geração, painéis direcionados, sequenciamento de exoma completo, características moleculares do câncer, são todos os jargões que encontramos. O que isso significa e como são úteis?
O que é o genoma do câncer / sequenciamento genômico?
Vamos começar com alguns princípios básicos do câncer. O câncer é um crescimento descontrolado de certas células em nosso corpo que se tornaram anormais devido ao acúmulo de alterações genéticas em nosso DNA celular, chamadas mutações ou aberrações genômicas. O DNA é composto por 4 nucleotídeos do alfabeto, cuja seqüência constitui os genes que dão instruções para formar as proteínas que dirigem as funções de nossas células, tecidos e órgãos. Sequenciamento é a decodificação do conteúdo genômico das células. O DNA das células cancerosas e das células normais não cancerosas pode ser isolado e, graças às inovações e avanços nas tecnologias de sequenciamento de última geração, pode ser decifrado no nível da sequência de nucleotídeos. A comparação das sequências de DNA do câncer e de controle fornece informações sobre as mudanças novas e adquiridas que, quando analisadas posteriormente, fornecem informações sobre as anormalidades subjacentes que estão causando a doença.
Diferentes tipos de sequenciamento
A identificação de mutações e anormalidades genômicas pode ser feita através de várias técnicas e testes, incluindo cariótipo citogenético, amplificação de regiões específicas do DNA por meio da reação em cadeia da polimerase (PCR), identificação de anormalidades específicas e fusões usando hibridização in situ fluorescente (FISH), sequenciamento genômico de um painel direcionado de genes específicos do câncer, ou o sequenciamento do conjunto completo de genes chamado sequenciamento de exoma completo (WES) ou o DNA inteiro da célula pode ser sequenciado como parte do sequenciamento de genoma completo (WGS). Para implementação clínica de Câncer Para criação de perfil, a opção preferida é o sequenciamento de painel de genes direcionados de genes específicos de câncer na faixa de 30 a 600 genes, enquanto WES e WGS são mais usados no domínio da pesquisa. As vantagens do sequenciamento direcionado são custos mais baixos, maior profundidade de sequenciamento e análise mais profunda de regiões específicas do DNA que podem ser os principais impulsionadores do câncer.
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O sequenciamento do genoma do câncer é útil - quais são seus benefícios?
Para um paciente com câncer, é necessário escolher o painel de teste certo para seu tipo específico de câncer. Diferentes tipos de câncer estão associados a diferentes conjuntos de mutações genéticas e painéis direcionados de várias empresas cobrem diferentes conjuntos de genes. Uma maior profundidade de cobertura das regiões genômicas que estão sendo sequenciadas tem vantagens em relação a uma amplitude de cobertura que se pode obter com o WES, mas pode perder algumas descobertas importantes. Ainda há uma falta de padronização nos testes de sequenciamento e variabilidade nos resultados ao sequenciar o DNA da mesma amostra em testes diferentes, em muitos casos. Também há variabilidade na sequência com base em qual parte da amostra de tumor é sequenciada e diferenças observadas entre o DNA de sequenciamento de uma amostra de tecido tumoral sólido e o DNA de tumor circulante do mesmo paciente. No entanto, apesar dos vários desafios, as informações obtidas a partir do sequenciamento genômico do câncer podem ser muito úteis de várias maneiras, conforme revisado por cientistas do Instituto Wellcome Sanger no Reino Unido (Nanglia e Campbell, New Engl J Med., 2019).
Algumas das maneiras pelas quais o genoma do câncer / sequenciamento genômico podem ser úteis no diagnóstico, decisão de tratamento e monitoramento do câncer estão listadas abaixo:
- Previsão de risco de câncer em um indivíduo saudável que pode ter histórico familiar de câncer. O sequenciamento do DNA da amostra de sangue de um indivíduo saudável pode fornecer informações sobre as mutações germinativas existentes que podem estar presentes e podem aumentar o risco futuro de câncer. Por exemplo. presença de mutações no gene de disposição do câncer em BRCA, APC ou VHL.
- Farmacogenômica - a genômica da linha germinativa pode identificar polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) em enzimas metabolizadoras de drogas que podem ser usadas para identificar pacientes em risco de efeitos tóxicos da quimioterapia.
- Epidemiologia e Saúde Pública - o sequenciamento genômico de tumores de regiões onde há uma alta incidência de um tipo específico de câncer pode ajudar a identificar o ambiente, a dieta ou outras exposições que podem estar por trás da alta incidência de câncer.
- O sequenciamento das lesões iniciais pode ajudar a determinar o prognóstico da doença e a necessidade de intervenção. A genômica com mais número de mutações / aberrações e o tipo de mutações pode ser identificada como aquela que necessita de intervenção precoce e mais agressiva.
- O diagnóstico de câncer pela identificação de mutações condutoras, como BCR_ABL, KRAS, TP53 e outros, pode confirmar o câncer subjacente.
- Identificação do tecido de origem para Câncer de um primário desconhecido. Mutações específicas estão associadas a tipos específicos de câncer.
- A classificação do tumor pode ser feita com base na composição das mutações condutoras e está ligada a uma biologia da doença que pode ser tratada com terapias direcionadas específicas.
- Prever resultados do paciente e fornecer melhor prognóstico com base em dados clínicos e genômicos. Por exemplo. Os tumores com mutações no TP53 têm pior prognóstico.
- O sequenciamento do genoma ajuda no tratamento de precisão do câncer - os pacientes com câncer têm muitas mutações e o complemento de mutações é único para cada paciente com câncer. Portanto, uma identificação de tratamento de combinação mais personalizada e customizada que pode abordar o impacto de todas as anormalidades seria o Santo Graal para o tratamento do câncer.
- Identificar mecanismos de resistência por sequenciamento do câncer que não respondeu aos tratamentos prescritos.
- O monitoramento do câncer por meio de biópsia líquida de DNA tumoral circulante ou células tumorais circulantes pode ajudar a identificar a recorrência da doença ou recidiva sem uma biópsia invasiva ou cirurgia.
Portanto, conforme listado, existem várias maneiras pelas quais Câncer o sequenciamento genômico/genômico pode ser útil, incluindo a previsão do risco de câncer, o prognóstico e o diagnóstico do câncer e a identificação do tratamento personalizado e preciso do câncer, embora não seja comum na maioria das práticas oncológicas.
Onde você pode fazer o Teste de Sequenciamento Genético para Câncer?
Existem várias empresas que oferecem teste de sequenciamento genômico / genético com base em amostras de saliva ou sangue com diferentes recursos que, conforme mencionado acima, precisarão ser identificados com base no contexto específico, tipo de câncer e finalidade. Existem alguns testes genéticos para câncer oferecidos por essas empresas que agora estão sendo reembolsados por planos governamentais como o Medicare ou o NHS, mas em muitos países como Índia e China, esses testes são pagos pelos pacientes. Consulte seus fornecedores de planos de saúde e planos de saúde para obter informações sobre os testes genéticos para câncer cobertos pelo seu plano. Você também pode verificar esta página para um Lista de testes genéticos aceitáveis para o risco de câncer.
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