Høydepunkter
Det er flere måter genom/genomisk sekvensering av pasienters kreftprøver kan være nyttig, inkludert prediksjon av kreftrisiko, kreftprognose og diagnose, og identifisering av personlig og presisjon kreft behandling. Det er mange selskaper som tilbyr varierte genetiske sekvenseringstester for kreft, og den riktige testen må identifiseres basert på spesifikk kontekst og krefttype. Noen genetiske tester som tilbys av disse selskapene er dekket av forsikring, men de fleste er basert på egenbetaling.
Det kan være overveldende å skanne gjennom anmeldelser, artikler, blogger, anbefalinger etc. Det er mye informasjon, ny terminologi og anbefalte tester som de fleste av oss er uklare om. Tumorsekvensering, kreft / svulstprofilering, neste generasjons sekvensering, målrettede paneler, heleksomsekvensering, kreftens molekylære egenskaper, er alt sjargonget vi møter. Hva betyr disse, og hvordan er disse nyttige?
Hva er kreftgenom/genomisk sekvensering?
La oss starte med noen grunnleggende om kreft. Kreft er en ukontrollert vekst av visse celler i kroppen vår som har blitt unormale på grunn av en akkumulering av genetiske endringer i vårt cellulære DNA, kalt mutasjoner eller genomiske avvik. DNA består av 4 alfabetnukleotider, hvis sekvens utgjør gener som gir instruksjoner om å lage proteinene som driver funksjonene til våre celler, vev og organer. Sekvensering er dekoding av det genomiske innholdet i cellene. DNA fra kreftcellene og normale ikke-kreftceller kan isoleres, og takket være innovasjonene og fremskrittene i neste generasjons sekvenseringsteknologier, kan de dekrypteres på nivået av nukleotidsekvensen. Sammenligning av kreft og kontroll-DNA-sekvenser gir informasjon om de nye og ervervede endringene som når videre analysert gir innsikt i de underliggende abnormitetene som driver sykdommen.
Ulike typer sekvensering
Identifikasjon av genomiske mutasjoner og abnormiteter kan gjøres gjennom ulike teknikker og tester inkludert cytogenetisk karyotyping, amplifisering av spesifikke regioner av DNA gjennom polymerasekjedereaksjon (PCR), identifikasjon av spesifikke abnormiteter og fusjoner ved bruk av fluorescens in situ hybridisering (FISH), genomisk sekvensering av et målrettet panel av kreftspesifikke gener, eller sekvenseringen av det komplette settet med gener kalt heleksomsekvensering (WES) eller hele DNA-et til cellen kan sekvenseres som en del av helgenomsekvensering (WGS). For klinisk implementering av kreft profilering er det foretrukne alternativet målrettet genpanelsekvensering av kreftspesifikke gener i området 30 – 600 gener, mens WES og WGS brukes mer i forskningsdomenet. Fordeler med målrettet sekvensering er lavere kostnader, større dybde på sekvensering og dypere analyse av spesifikke DNA-regioner som kan være nøkkeldrivere for kreften.
Mat å spise etter kreftdiagnose!
Ingen to kreftformer er like. Gå utover de vanlige ernæringsretningslinjene for alle og ta personlige beslutninger om mat og kosttilskudd med tillit.
Er kreftgenom sekvensering nyttig - hva er fordelene?
For en kreftpasient må man velge det riktige testpanelet for sin spesifikke krefttype. Ulike kreftformer er assosiert med forskjellige sett med genmutasjoner og målrettede paneler fra forskjellige selskaper dekker forskjellige sett med gener. En høyere dekningsdybde for de genomiske områdene som sekvenseres, har fordeler i forhold til en dekning som man kan få med WES, men det kan gå glipp av noen viktige funn. Det er fortsatt mangel på standardisering på tvers av sekvenseringstester og variabilitet i resultater ved sekvensering av DNA fra samme prøve på tvers av forskjellige tester, i mange tilfeller. Det er også variabilitet i sekvensen basert på hvilken del av tumorprøven som er sekvensert og forskjeller sett mellom sekvensering av DNA fra en fast tumorvevsprøve og sirkulerende tumor -DNA fra den samme pasienten. Til tross for de ulike utfordringene, kan imidlertid informasjonen fra genomisk sekvensering av kreft være veldig nyttig på flere måter, slik forskere fra Wellcome Sanger Institute i Storbritannia (Nanglia og Campbell, New Engl J Med., 2019).
Noen av måtene som kreftgenom/genomisk sekvensering kan være nyttig for å diagnostisere, bestemme behandling og overvåke kreft, er oppført nedenfor:
- Kreftrisiko-spådom hos et sunt individ som kan ha en familiehistorie av kreft. Sekvensering av DNA fra blodprøven til et sunt individ kan gi informasjon om eksisterende kimlinjemutasjoner som kan være til stede og kan øke fremtidig kreftrisiko. F.eks. tilstedeværelse av kreft-disposisjon genmutasjoner i BRCA, APC eller VHL.
- Farmakogenomics - germline genomics kan identifisere single nucleotide polymorphisms (SNPs) i medikamentmetaboliserende enzymer som kan brukes til å identifisere pasienter med risiko for toksiske effekter av cellegift.
- Epidemiologi og folkehelse - genomisk sekvensering av svulster fra regioner der det er høy forekomst av en bestemt krefttype, kan hjelpe til med å identifisere miljø-, diett- eller annen eksponering som kan ligge til grunn for den høye forekomsten av kreft.
- Sekvensering av tidlige lesjoner kan hjelpe til med å bestemme prognosen for sykdommen og behov for intervensjon. Genomics med flere antall mutasjoner / avvik og typen mutasjoner, kan identifiseres som de som trenger tidlig og mer aggressiv intervensjon.
- Kreftdiagnose ved å identifisere drivermutasjoner som BCR_ABL, KRAS, TP53 og andre kan bekrefte den underliggende kreften.
- Identifikasjon av opprinnelsesvev for kreft av en ukjent primær. Spesifikke mutasjoner er assosiert med spesifikke krefttyper.
- Tumorklassifisering kan gjøres på grunnlag av sammensetningen av drivermutasjoner og er knyttet til en sykdomsbiologi som kan behandles med spesifikke målrettede terapier.
- Forutsi pasientresultater og gi bedre prognoser basert på kliniske og genomiske data. F.eks. Svulster med TP53-mutasjoner har dårligere prognose.
- Genom-sekvensering hjelper med presisjonskreftbehandling- Kreftpasienter har mange mutasjoner, og komplementet til mutasjoner er unikt for hver kreftpasient. Derfor vil en mer personlig og tilpasset kombinasjonsbehandlingsidentifikasjon som kan håndtere virkningen av alle abnormiteter være den hellige gralen for kreftbehandling.
- Identifisere motstandsmekanismer ved sekvensering av kreft som ikke har svart på foreskrevne behandlinger.
- Kreftovervåking gjennom flytende biopsi av sirkulerende tumor-DNA eller sirkulerende tumorceller kan bidra til å identifisere tilbakefall av sykdom eller tilbakefall uten en invasiv biopsi eller kirurgi.
Derfor, som nevnt, er det flere måter kreft Genomisk/genomsekvensering kan være nyttig, inkludert prediksjon av kreftrisiko, kreftprognose og diagnose, og identifisering av personlig og presis kreftbehandling, selv om det ikke er mainstream i de fleste onkologipraksis.
Hvor kan du få utført genetisk sekvenseringstest for kreft?
Det finnes en rekke selskaper som tilbyr genomisk/genetisk sekvenseringstest basert på spytt eller blodprøver med forskjellige evner, som som nevnt ovenfor må identifiseres basert på spesifikk kontekst, krefttype og formål. Det er noen få genetiske tester for kreft som tilbys av disse selskapene som nå blir refundert av regjeringsplaner som Medicare eller NHS, men i mange land som India og Kina betales disse testene av pasientene. Rådfør deg med helsepersonell og forsikringsleverandører for å få informasjon om de genetiske testene for kreft som er dekket i planen din. Du kan også sjekke denne siden for a liste akseptable genetiske tester for kreftrisiko.
Hvilken mat du spiser og hvilke kosttilskudd du tar er en beslutning du tar. Avgjørelsen din bør omfatte vurdering av kreftgenmutasjonene, hvilke kreftformer, pågående behandlinger og kosttilskudd, eventuelle allergier, livsstilsinformasjon, vekt, høyde og vaner.
Ernæringsplanleggingen for kreft fra addon er ikke basert på internett søk. Den automatiserer beslutningstaking for deg basert på molekylærvitenskap implementert av våre forskere og programvareingeniører. Uansett om du bryr deg om å forstå de underliggende biokjemiske molekylære veiene eller ikke - for ernæringsplanlegging for kreft, er den forståelsen nødvendig.
Kom i gang NÅ med ernæringsplanleggingen din ved å svare på spørsmål om navn på kreft, genetiske mutasjoner, pågående behandlinger og kosttilskudd, eventuelle allergier, vaner, livsstil, aldersgruppe og kjønn.
Personlig tilpasset ernæring for kreft!
Kreft endrer seg med tiden. Tilpass og modifiser ernæringen din basert på kreftindikasjon, behandlinger, livsstil, matpreferanser, allergier og andre faktorer.
Kreftpasienter må ofte forholde seg til forskjellige cellegift bivirkninger som påvirker livskvaliteten og ser etter alternative behandlinger for kreft riktig ernæring og kosttilskudd basert på vitenskapelige hensyn (unngå gjetning og tilfeldig utvalg) er det beste naturlige middelet for kreft og behandlingsrelatert bivirkninger.