Highlights
Es gibt mehrere Möglichkeiten, wie Genom-/Genomsequenzierung von Krebsproben von Patienten kann hilfreich sein, einschließlich der Vorhersage des Krebsrisikos, der Krebsprognose und -diagnose sowie der Identifizierung von Personalisierung und Präzision Krebs Behandlung. Es gibt viele Unternehmen, die verschiedene genetische Sequenzierungstests für Krebs anbieten, und der richtige Test muss basierend auf dem spezifischen Kontext und der Krebsart identifiziert werden. Einige Gentests, die von diesen Unternehmen angeboten werden, sind von einer Versicherung abgedeckt, die meisten basieren jedoch auf Selbstzahler.
Das Durchsuchen von Rezensionen, Artikeln, Blogs, Empfehlungen usw. nach einer Krebsdiagnose kann überwältigend sein. Es gibt viele Informationen, neue Terminologie und empfohlene Tests, von denen die meisten von uns keine Ahnung haben. Tumorsequenzierung, Krebs-/Tumor-Profiling, Next-Generation-Sequenzierung, gezielte Panels, Whole-Exom-Sequenzierung, molekulare Eigenschaften des Krebses sind all die Fachbegriffe, die uns begegnen. Was bedeuten diese und wie sind diese hilfreich?
Was ist Krebsgenom/Genomsequenzierung?
Beginnen wir mit einigen Krebsgrundlagen. Krebs ist ein unkontrolliertes Wachstum bestimmter Zellen in unserem Körper, die aufgrund einer Anhäufung genetischer Veränderungen in unserer zellulären DNA, die als Mutationen oder genomische Aberrationen bezeichnet werden, abnormal geworden sind. Die DNA besteht aus 4 alphabetischen Nukleotiden, deren Sequenz die Gene bildet, die Anweisungen zur Herstellung der Proteine geben, die die Funktionen unserer Zellen, Gewebe und Organe antreiben. Die Sequenzierung ist die Entschlüsselung des genomischen Inhalts der Zellen. DNA aus Krebszellen und normalen Nicht-Krebszellen kann isoliert und dank der Innovationen und Fortschritte in den Sequenzierungstechnologien der nächsten Generation auf der Ebene der Nukleotidsequenz entschlüsselt werden. Der Vergleich der Krebs- und Kontroll-DNA-Sequenzen liefert Informationen über die neuen und erworbenen Veränderungen, die bei weiterer Analyse Einblicke in die zugrunde liegenden Anomalien geben, die die Krankheit antreiben.
Verschiedene Arten der Sequenzierung
Die Identifizierung genomischer Mutationen und Anomalien kann durch verschiedene Techniken und Tests erfolgen, einschließlich zytogenetischer Karyotypisierung, Amplifikation bestimmter DNA-Regionen durch Polymerase-Kettenreaktion (PCR), Identifizierung spezifischer Anomalien und Fusionen unter Verwendung von Fluoreszenz-in-situ-Hybridisierung (FISH), Genomsequenzierung von eine zielgerichtete Gruppe krebsspezifischer Gene oder die Sequenzierung des vollständigen Satzes von Genen, die als Whole-Exome-Sequencing (WES) bezeichnet wird, oder die gesamte DNA der Zelle kann als Teil der Whole-Genome-Sequencing (WGS) sequenziert werden. Für die klinische Umsetzung von Krebs Profiling ist die bevorzugte Option die gezielte Gen-Panel-Sequenzierung von krebsspezifischen Genen im Bereich von 30 bis 600 Genen, während WES und WGS eher im Forschungsbereich eingesetzt werden. Vorteile der gezielten Sequenzierung sind niedrigere Kosten, eine größere Sequenzierungstiefe und eine tiefere Analyse bestimmter DNA-Regionen, die Schlüsselfaktoren für den Krebs sein können.
Essen nach der Krebsdiagnose!
Keine zwei Krebsarten sind gleich. Gehen Sie über die üblichen Ernährungsrichtlinien für alle hinaus und treffen Sie mit Zuversicht personalisierte Entscheidungen über Lebensmittel und Nahrungsergänzungsmittel.
Ist die Genomsequenzierung bei Krebs hilfreich – was sind ihre Vorteile?
Für einen Krebspatienten muss man das richtige Testpanel für seinen spezifischen Krebstyp auswählen. Verschiedene Krebsarten werden mit unterschiedlichen Genmutationen in Verbindung gebracht und gezielte Panels von verschiedenen Unternehmen decken unterschiedliche Gengruppen ab. Eine höhere Abdeckungstiefe der zu sequenzierenden Genomregionen hat Vorteile gegenüber einer Abdeckungsbreite, die mit WES erreicht werden kann, aber sie kann einige wichtige Erkenntnisse übersehen. In vielen Fällen fehlt es noch an Standardisierung über die Sequenzierungstests und an Variabilität in den Ergebnissen, wenn DNA aus derselben Probe über verschiedene Tests hinweg sequenziert wird. Es gibt auch eine Variabilität in der Sequenz basierend darauf, welcher Teil der Tumorprobe sequenziert wird, und es werden Unterschiede zwischen der Sequenzierung von DNA aus einer festen Tumorgewebeprobe und der zirkulierenden Tumor-DNA desselben Patienten beobachtet. Trotz der verschiedenen Herausforderungen können die aus der Genomsequenzierung des Krebses gewonnenen Informationen jedoch in mehrfacher Hinsicht sehr nützlich sein, wie von Wissenschaftlern des Wellcome Sanger Institute im Vereinigten Königreich (Nanglia und Campbell, New Engl J Med., 2019).
Nachfolgend sind einige der Möglichkeiten aufgeführt, auf die die Krebsgenom-/Genomsequenzierung bei der Diagnose, Behandlung und Überwachung von Krebs hilfreich sein kann:
- Krebsrisikovorhersage bei einer gesunden Person, die in der Familienanamnese möglicherweise Krebs hat. Die Sequenzierung von DNA aus der Blutprobe eines gesunden Individuums kann Aufschluss über bestehende Keimbahnmutationen geben, die möglicherweise vorhanden sind und das zukünftige Krebsrisiko erhöhen können. Z.B. Vorhandensein von Mutationen des Krebsdispositionsgens in BRCA, APC oder VHL.
- Pharmakogenomik – Keimbahngenomik kann Einzelnukleotidpolymorphismen (SNPs) in Arzneimittel-metabolisierenden Enzymen identifizieren, die verwendet werden könnten, um Patienten mit einem Risiko für toxische Wirkungen einer Chemotherapie zu identifizieren.
- Epidemiologie und öffentliche Gesundheit – Die genomische Sequenzierung von Tumoren aus Regionen, in denen eine bestimmte Krebsart häufig vorkommt, kann bei der Identifizierung von Umwelt-, Ernährungs- oder anderen Expositionen helfen, die der hohen Krebsinzidenz zugrunde liegen könnten.
- Die Sequenzierung früher Läsionen kann bei der Bestimmung der Prognose der Krankheit und der Notwendigkeit einer Intervention helfen. Genomik mit einer größeren Anzahl von Mutationen/Aberrationen und der Art der Mutationen können als diejenigen identifiziert werden, die ein frühes und aggressiveres Eingreifen benötigen.
- Die Krebsdiagnose durch Identifizierung von Treibermutationen wie BCR_ABL, KRAS, TP53 und anderen kann den zugrunde liegenden Krebs bestätigen.
- Identifizierung des Ursprungsgewebes für Krebs eines unbekannten Primärs. Bestimmte Mutationen sind mit bestimmten Krebsarten assoziiert.
- Die Tumorklassifizierung kann anhand der Zusammensetzung von Treibermutationen erfolgen und ist mit einer Krankheitsbiologie verbunden, die mit gezielten Therapien behandelt werden kann.
- Vorhersage von Patientenergebnissen und bessere Prognose basierend auf klinischen und genomischen Daten. Z.B. Tumore mit TP53-Mutationen haben eine schlechtere Prognose.
- Genomsequenzierung hilft bei der Präzisions-Krebsbehandlung – Krebspatienten haben viele Mutationen und das Komplement der Mutationen ist für jeden Krebspatienten einzigartig. Daher wäre eine personalisiertere und individuellere Identifizierung von Kombinationsbehandlungen, die die Auswirkungen aller Anomalien berücksichtigen kann, der heilige Gral für die Krebsbehandlung.
- Identifizierung von Resistenzmechanismen durch Sequenzierung des Krebses, der nicht auf verschriebene Behandlungen angesprochen hat.
- Die Krebsüberwachung durch Flüssigbiopsie zirkulierender Tumor-DNA oder zirkulierender Tumorzellen kann dabei helfen, ein Wiederauftreten der Krankheit oder einen Rückfall ohne invasive Biopsie oder Operation zu erkennen.
Daher gibt es, wie aufgeführt, mehrere Möglichkeiten, wie Krebs Die Genom-/Genomsequenzierung kann hilfreich sein, einschließlich der Vorhersage des Krebsrisikos, der Krebsprognose und -diagnose und der Identifizierung personalisierter und präziser Krebsbehandlungen, obwohl sie in den meisten onkologischen Praxen nicht gängige Praxis ist.
Wo kann man den genetischen Sequenzierungstest für Krebs durchführen lassen?
Es gibt eine Reihe von Unternehmen, die genomische/genetische Sequenzierungstests basierend auf Speichel- oder Blutproben mit unterschiedlichen Fähigkeiten anbieten, die, wie oben erwähnt, basierend auf dem spezifischen Kontext, der Krebsart und dem Zweck identifiziert werden müssen. Es gibt einige genetische Krebstests, die von diesen Unternehmen angeboten werden, die jetzt von staatlichen Plänen wie Medicare oder dem NHS erstattet werden, aber in vielen Ländern wie Indien und China werden diese Tests von den Patienten bezahlt. Bitte wenden Sie sich an Ihren Arzt und Ihre Krankenkasse, um Informationen zu den genetischen Krebstests zu erhalten, die in Ihrem Plan enthalten sind. Sie können auch auf dieser Seite nach a Liste von akzeptablen genetischen Tests für das Krebsrisiko.
Welche Lebensmittel Sie essen und welche Nahrungsergänzungsmittel Sie einnehmen, ist eine Entscheidung, die Sie treffen. Ihre Entscheidung sollte die Mutationen des Krebsgens, den Krebs, laufende Behandlungen und Nahrungsergänzungsmittel, Allergien, Informationen zum Lebensstil, Gewicht, Größe und Gewohnheiten berücksichtigen.
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